Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms