Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms