Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cdkn2cQ60772 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cdkn2cQ60772 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cdkn2cQ60772 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cdkn2cQ60772 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cdkn2cQ60772 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cdkn2cQ60772 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cdkn2cQ60772 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cdkn2cQ60772 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cdkn2cQ60772 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdkn2cQ60772 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cdkn2cQ60772 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cdkn2cQ60772 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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