Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SkiQ60698 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SkiQ60698 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms