Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3aQ60520 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms