Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brip1Q5SXJ3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms