Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX79

Shroom1, Protein Shroom1, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom1Q5SX79 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom1Q5SX79 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.5 ms