Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PkdccQ5RJI4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PkdccQ5RJI4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PkdccQ5RJI4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PkdccQ5RJI4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PkdccQ5RJI4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PkdccQ5RJI4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PkdccQ5RJI4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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