Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtp3Q5QGU6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rtp3Q5QGU6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms