Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vps41Q5KU39 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms