Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms