Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms