Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

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Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnah12Q3V0Q1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Dnah12Q3V0Q1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnah12Q3V0Q1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms