Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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