Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pfdn4Q3UWL8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pfdn4Q3UWL8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pfdn4Q3UWL8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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