Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms