Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
E130208F15RikQ3UPV3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms