Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rnf224Q3UIW8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf224Q3UIW8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf224Q3UIW8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms