Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trafd1Q3UDK1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms