Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atxn7l3bQ3UD01 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atxn7l3bQ3UD01 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atxn7l3bQ3UD01 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atxn7l3bQ3UD01 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atxn7l3bQ3UD01 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atxn7l3bQ3UD01 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atxn7l3bQ3UD01 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atxn7l3bQ3UD01 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atxn7l3bQ3UD01 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atxn7l3bQ3UD01 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atxn7l3bQ3UD01 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atxn7l3bQ3UD01 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atxn7l3bQ3UD01 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atxn7l3bQ3UD01 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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