Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec24aQ3U2P1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms