Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf149Q3U2C5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf149Q3U2C5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf149Q3U2C5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf149Q3U2C5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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