Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hace1Q3U0D9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms