Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700066B19RikQ3TS39 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms