Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarca4Q3TKT4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smarca4Q3TKT4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smarca4Q3TKT4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms