Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim71Q1PSW8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim71Q1PSW8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms