Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300lgQ1ERP8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300lgQ1ERP8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms