Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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ptchd1Q14B62 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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ptchd1Q14B62 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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ptchd1Q14B62 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ptchd1Q14B62 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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ptchd1Q14B62 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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ptchd1Q14B62 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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ptchd1Q14B62 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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ptchd1Q14B62 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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ptchd1Q14B62 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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ptchd1Q14B62 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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