Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ttc39dQ0VF76 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc39dQ0VF76 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms