Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rab42Q0PD08 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms