Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms