Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
AmbpQ07456 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms