Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Siah1bQ06985 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms