Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox4Q06831 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox4Q06831 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms