Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Prrx2Q06348 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms