Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcad1Q04692 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms