Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nf1Q04690 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms