Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms