Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnb1Q03717 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms