Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tff2Q03404 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms