Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Mmp11Q02853 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mmp11Q02853 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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