Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd1Q02242 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms