Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grin2cQ01098 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms