Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms