Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
rp9P97762 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
rp9P97762 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
rp9P97762 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
rp9P97762 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
rp9P97762 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
rp9P97762 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
rp9P97762 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
rp9P97762 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
rp9P97762 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
rp9P97762 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
rp9P97762 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
rp9P97762 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
rp9P97762 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
rp9P97762 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
rp9P97762 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms