Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psme1P97371 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psme1P97371 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psme1P97371 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psme1P97371 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psme1P97371 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psme1P97371 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psme1P97371 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psme1P97371 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Psme1P97371 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme1P97371 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms