Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms