Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Arf1P84078 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Arf1P84078 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Arf1P84078 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Arf1P84078 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Arf1P84078 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Arf1P84078 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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