Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms