Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux2P70298 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux2P70298 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux2P70298 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cux2P70298 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux2P70298 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cux2P70298 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux2P70298 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cux2P70298 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms